金门战役是由 叶飞和 萧锋共同指挥的。
叶飞是解放军第三野战军第十兵团的司令员，他原本负责指挥金门战役，但后来由于种种原因，他并没有直接指挥这场战役，而是将指挥权交给了第二十八军。
萧锋在战役初期担任第二十八军军长，但由于原军长朱绍清因病无法指挥，萧锋临时接替其职务，成为金门战役的前线指挥官。在战役过程中，萧锋制定了详细的作战计划，但最终由于多种不利因素，战役以失败告终。
因此，金门战役的指挥权主要由叶飞和萧锋两人承担，其中叶飞为总指挥，萧锋为前线指挥官。