文书档案归档文件目录的编制应遵循以下步骤和原则：
确定归档文件的主题或类别
根据文件的内容和性质，将其归类到相应主题或类别，例如人事档案、财务档案等。
细分子类别
在每个主题或类别下，进一步细分子类别。例如，在人事档案下，可以分为员工档案、招聘档案、考勤档案等。
根据要素进行分类
在每个子类别下，根据时间、部门、姓名等要素进行分类。例如，员工档案可以按照入职时间、员工编号、岗位等要素进行分类，便于查找和管理。
编制归档文件目录
归档文件目录应包括以下项目：序号、档号、文号、责任者、题名、日期、密级、页数、备注等。
序号：填写归档文件的顺序号。
档号：按照《归档文件整理规则》编制。
文号：文件的发文字号。
责任者：制发文件的组织或个人。
题名：文件的标题。
日期：文件的日期。
密级：文件的密级。
页数：文件的页面总数。
备注：注释文件需说明的情况。
保存和装订
归档文件目录应保存电子版本，并打印装订成册。装订成册的归档文件目录应编制封面，包括全宗号、全宗名称、年度、保管期限、机构等信息。
定期检查和整理
定期对归档文件进行检查和整理，删除过期的文件，更新目录内容，保持文件目录的准确性和完整性。
使用系统或电子表格
推荐由系统生成或使用电子表格进行编制，目录表格采用A4幅面，页面宜横向设置。
通过以上步骤和原则，可以确保文书档案归档文件目录的编制科学、系统、准确，便于文件的检索和管理。