电商补税的操作步骤如下：
确定补税范围
平台内交易：包括B2B、B2C、C2C等模式的所有交易。
跨境交易：对跨境电商平台上的交易进行补税，确保税收公平。
个人代购：对个人代购行为进行补税，以防止税收流失。
税务核定
税务部门根据电商经营者的经营情况核定应纳税额，电商经营者按照核定结果进行缴纳。
代扣代缴
电商平台在结算时自动扣除应纳税款，并代为缴纳给税务部门。
自行申报
电商经营者自行向税务部门申报应纳税额，并按时缴纳税款。
建立有效的监管机制
电商补税方案应建立配套的监管机制，如通过大数据分析和人工智能技术，实现对电商交易的实时监控和税收征收。
明确税收征收原则
电商补税方案应明确对跨境电商的税收征收原则，避免出现税收逃避现象，并通过税收协定或合作机制维护税收的合理性和公平性。
考虑发展的平衡性
电商补税方案应考虑到税收政策的平衡性，避免对电商行业造成过大的负担。
补税通知
税务部门会向电商经营者发出补税通知，告知其需要补税的具体金额和缴税期限。
补税方式
电商经营者可以选择自行申报或由电商平台代扣代缴的方式进行补税。
其他注意事项
电商公司要补税时，可以考虑通过变更公司主体或转变业务性质等方式来降低税收负担。
建议电商经营者在接到补税通知后，应仔细核对税务核定结果，确保补税金额无误，并及时完成缴税。同时，应关注税务政策的最新动态，合理规划税务事宜，以降低税收风险。