电商自查补税可以按照以下步骤进行：
收集和整理财务数据
整理所有相关的财务记录，包括销售收入、成本、费用、进项税额、销项税额等。确保所有数据准确无误，并分类整理好。
对比和分析
将实际财务数据与电商平台统计的销售收入进行对比，查找是否存在少计销售收入的情况。
分析其他可能的税收风险，例如广告费、服务费、佣金等是否按规定申报和缴纳。
计算应补缴税款
根据对比分析的结果，计算应补缴的税款，包括按适用税率计算的纳税检查应补缴税额、应抵扣税额合计等。
具体填表方法可以参考如下：
自查收入填到第4栏"纳税检查调整的销售额"。
自查税款加到第11行"销项税额"、第16行"按适用税率计算的纳税检查应补缴税额"、第17行"应抵扣税额合计"。其中，17=12+13-14-15+16。
准备自查报告
撰写一份详细的自查报告，说明自查的过程、发现的问题、补缴税款的情况等。
报告应附上相关的财务数据表格和计算依据，以便税务机关审查。
提交自查报告
将自查报告和相关财务资料提交给税务机关，配合税务机关的审查工作。
如果存在疑问或需要进一步的解释，及时与税务机关沟通，确保自查补税的过程透明、合规。
后续改进
根据自查结果，制定并实施改进措施，确保今后税务申报和缴纳工作更加准确、合规。
定期对财务和税务情况进行自查，及时发现和纠正潜在问题，避免类似情况再次发生。
通过以上步骤，电商企业可以系统地进行自查补税，确保自身税收合规，避免偷税漏税等不合法行为。