电商查账交税的方式主要涉及以下几个方面：
查账征收
定义：查账征收是税务机关依据企业账簿记录的收入进行征税的方式。对于能够建立清晰账本的企业，税务部门会审查其账目，核实收入情况，并按照适用的税率计算税款。
操作步骤：
准备账簿：电商企业需要按照国家相关法规设置账簿，记录所有收入、支出和资产情况。
税务申报：企业需要定期（如每月或每季度）向税务机关提交财务报表和税务申报表。
税务审核：税务部门会对企业提交的财务报表和税务申报表进行审核，核实收入、成本、费用等项目的真实性。
第三方支付平台数据共享
合作方式：税务部门与第三方支付平台（如支付宝、微信支付）合作，获取商户的交易明细。这些数据包括交易时间、金额、交易双方信息等，帮助税务机关核实企业的真实收入情况。
操作步骤：
数据同步：电商企业需要与第三方支付平台签订数据共享协议，确保交易数据能够实时同步到税务系统中。
税务核查：税务部门通过分析这些数据，核实企业的销售额和实际收入，确保税收的正确征收。
电子税务局在线办理
平台选择：电商企业可以通过国家税务总局的电子税务局平台进行税务业务的在线办理。
操作步骤：
注册/登录：企业需要在电子税务局平台进行注册或登录。
税务申报：在平台上填写各类税务申报表，并提交给税务机关。
查询与反馈：企业可以查询申报状态，并及时获取税务机关的反馈信息。
财务软件辅助
软件选择：电商企业可以选择适合的财务软件，如用友、金蝶等，这些软件能够自动同步电商平台的数据，并生成清晰的财务报表。
操作步骤：
软件安装与配置：安装并配置财务软件，确保其能够连接到电商平台和第三方支付平台。
数据录入：将电商平台和第三方支付平台的交易数据录入财务软件。
报表生成与申报：软件会自动生成财务报表和税务申报表，企业只需确认并在线提交。
税务合规与咨询
税法咨询：电商企业可以通过税务软件或专业税务顾问了解最新的税法政策，确保合规操作。
定期审计：企业可以定期进行内部审计，确保账目清晰、数据准确，避免偷税漏税的风险。
建议
选择合适的财务软件：根据企业规模和业务需求，选择功能强大且操作简便的财务软件，确保财务数据的准确性和及时性。
保持与第三方支付平台的合作：与第三方支付平台建立良好的合作关系，确保交易数据的实时同步和准确无误。
定期进行税务审计：定期进行内部审计和税务申报，确保企业的税务合规性，避免法律风险。
及时关注税法政策：通过税务软件或专业税务顾问，及时了解并遵守最新的税法政策，确保企业的合法经营。