自然疫源地是指某些可引起人类传染病的病原体在自然界的野生动物中长期存在和循环的地区。这些地区通常具有特定的动物传染源、传播媒介及病原体在动物间传播的自然条件，当人类进入这种地区时，有可能被感染得病。
我国地域辽阔，自然疫源地分布广泛，以下是一些主要的自然疫源地分布情况：
鼠疫自然疫源地
青藏高原喜马拉雅旱獭疫源地：分布在青海、甘肃、新疆、西藏、四川的广大高原、草原和山地地区。
帕米尔高原长尾旱獭疫源地：主要位于我国新疆的帕米尔高原地区。
天山山地灰旱獭、长尾黄鼠疫源地：在新疆的天山山地一带。
钩端螺旋体病疫源地
我国大多数省份都有钩体病的存在和流行，尤其是南方的一些水稻种植区，如长江流域及以南的湿地、湖泊周边地区。这些地方的鼠类和猪等家畜是主要宿主，病原体可通过其尿液污染水体和土壤。
布鲁氏菌病疫源地
在内蒙古、新疆等广大草原地区，布鲁氏菌病较为常见，主要在羊、牛等家畜和野生的鹿、羚羊等动物之间传播。
森林脑炎疫源地
主要分布在东北和西北的森林地区，如黑龙江、吉林、辽宁等省的林区以及新疆部分森林地带，其病原体主要在蜱和野生脊椎动物之间循环。
克里米亚 - 刚果出血热疫源地
在新疆等地的部分荒漠地区是克里米亚 - 刚果出血热的自然疫源地，其病原体主要宿主是蜱和野生的羊、骆驼等动物。
了解自然疫源地的分布规律，可以对这些疾病的发生进行预测预报，预防疾病的传播和消灭某些疾病的原始疫源地。