农村合作医疗（新农合）与社保（城镇职工社保）在多个方面存在显著差异，具体区别如下：
一、参保对象
农村合作医疗
仅限农村户口居民参加，且通常以家庭为单位整户参保。
社保（城镇职工社保）
覆盖城镇在职职工及城镇居民，职工需通过单位缴费，非就业人员可参加城乡居民社保（原新农合）。
二、保障范围与期限
保障范围
- 农村合作医疗：主要报销门诊、住院费用，部分地区包含大病保险。
- 社保：包含养老、医疗、失业、工伤和生育保险，医疗保障范围更广。
保障期限
- 农村合作医疗：交一年保一年，需每年缴费才能享受。
- 社保（医疗险）：需累计缴纳满15年才能享受终身待遇。
三、缴费标准与方式
缴费标准
- 农村合作医疗：个人缴费为主，政府补贴较少，年缴费用约200元。
- 社保：缴费金额较高（如职工社保最低档约800元/月，职工个人缴纳部分约200-400元）。
缴费方式
- 农村合作医疗：自愿参保，无强制缴费义务。
- 社保：职工由单位代扣代缴，属于强制性的社会保险。
四、报销比例与待遇
报销比例
- 农村合作医疗：门诊报销比例较高（约50%-75%），住院报销比例约70%-75%。
- 社保：门诊报销比例较低（约5%-15%），住院报销比例达80%以上。
待遇差异
- 农村合作医疗：无个人医保账户，门诊需自费，住院报销后可能面临封顶线。
- 社保：有个人医保账户，门诊可刷卡报销，住院费用按比例报销且无封顶线。
五、其他区别
管理主体
- 农村合作医疗：由卫生局管理。
- 社保：由社保系统管理。
异地就医
- 农村合作医疗：需办理转诊手续，跨区域就医自费后报销。
- 社保：支持异地就医直接结算，但需备案。
总结
农村合作医疗适合短期或低收入农民，提供基础医疗保障；社保（城镇职工社保）适合长期就业人员，保障更全面且待遇更高。随着新型农村合作医疗与城镇居民医疗保险的合并，两者在制度上已趋统一，但覆盖人群和保障水平仍存在本质差异。