陈文锦在《盗墓笔记》中害怕潘子的核心原因是她怀疑潘子是敌对势力的卧底。这一怀疑贯穿了剧情发展，并对她的行为产生重要影响：
怀疑潘子的身份 陈文锦自幼与敌对势力有牵连，她曾因家族被陷害而经历生死考验，对敌对势力保持警惕。潘子作为与她有交集的神秘人物，其行为和背景始终让陈文锦心存疑虑，尤其是潘子多次表现出与敌对势力相似的行事风格。
剧情发展中的关键转折
- 初次相遇的矛盾： 陈文锦在沼泽中初次见到吴邪等人时选择逃跑，但在潘子昏倒后却主动出现，这一行为进一步加深了她的矛盾心理。她既想保持与敌对势力的距离，又对潘子的真实意图难以判断。 - 卧底身份的暴露
个人背景的关联
陈文锦自身背负家族秘密（如被喂食尸蟞丹的副作用），她深知身份暴露的后果。因此，她对潘子的恐惧不仅源于对卧底的担忧，也包含对自身处境的自我保护。
综上，陈文锦对潘子的害怕是多重因素共同作用的结果：对卧底身份的怀疑、剧情发展的推动，以及个人经历带来的心理阴影。