工程勘察设计收费根据建设项目投资额的不同情况，分别实行政府指导价和市场调节价。具体收费标准和计算方法如下：
政府指导价
适用范围：建设项目总投资估算额500万元及以上的工程勘察和工程设计收费。
基准价：根据《工程勘察收费标准》或者《工程设计收费标准》计算，浮动幅度为上下20%。
上浮条件：在工程勘察设计中采用新技术、新工艺、新设备、新材料，有利于提高建设项目经济效益、环境效益和社会效益的，可以在上浮25%的幅度内协商确定收费额。
市场调节价
适用范围：建设项目总投资估算额500万元以下的工程勘察和工程设计收费。
收费标准：由发包人和勘察人、设计人协商确定收费额。
工程设计费计算方法
基准价计算：根据计价格10号收费标准，工程设计费收费一般根据计费额所在相对应的区间内用插入法计算设计收费基价，并考虑行业调整系数、工程复杂程度及折扣等因素进行调整计算。
计算公式：
$$
\text{工程设计费} = (\text{工程设计收费基价} \times \text{专业调整系数} \times \text{工程复杂程度调整系数} \times \text{附加调整系数} + \text{其他设计收费}) \times \text{折扣}
$$
举例：某房屋建筑工程项目，工程复杂程度为III级，计费额为12800万元，按照计价格10号标准打5折，计算项目工程设计收费（不计其他设计收费）的步骤及结果为2174420元。
地方标准
甘肃省：发布了《甘肃省工程勘察设计收费指导标准》（2022年版），涵盖了房屋建筑设计、工程勘察、建筑装饰工程等多个领域。
海南省：编制了《海南省工程勘察设计收费导则（试行）》，自2024年12月起正式实施，作为合同审查和市场监管的参考计算依据。
江苏省：发布了《江苏省工程勘察设计收费导则》，于2024年9月1日正式发布，供各有关单位参考使用。
建议在实际应用中，结合具体项目的实际情况和当地的具体规定，选择合适的收费标准和计算方法，以确保收费的合理性和合法性。