红色资源是指我们党艰辛而辉煌奋斗历程的见证，是红色文化的载体，是中华民族主体性的重要精神标识。它包括重要旧址、遗址、遗迹、遗物、纪念设施或场所，重要档案、文献、声像、照片资料等，英烈模范人物和集体形象、事迹，以及具有重要影响力的文艺作品、口述历史、红色地名等具有代表性的其他资源。
根据这个定义，我们可以逐一分析选项：
A. 遗物、遗迹：这是红色资源的一部分，因为它们是我们党奋斗历程的见证。
B. 手稿、著作：这也是红色资源的一部分，因为它们包含了重要的历史文献和资料。
C. 音像、记录：这同样是红色资源的一部分，因为它们记录了重要的历史瞬间和事件。
D. 国旗：国旗并不直接反映我们党的奋斗历程和红色文化，因此不属于红色资源的范畴。
综上所述，红色资源不包括国旗。
建议：在学习和了解红色资源时，应重点掌握那些能够反映党和人民群众奋斗历程、体现红色文化精神内涵的资源，而国旗作为一个国家的象征，虽然重要，但不属于红色资源的范畴。