电商购房退税的操作流程如下：
申请
纳税人向其主管征收机关提出申请，同时按照征收机关的要求报送有关资料。
纳税人需要填写《契税退税（款）申请审核表》，并提交相关材料。
受理与审核
征收机关确认报送资料齐全后，当场受理退税申请并审核纳税人填写的表格是否符合要求。
征收机关会核查申请情况属实后，形成退税意见，并报分管处长、处长及分管局长审批。
批准与办理退税
经查实，对情况属实的，审批后开具退税凭证。
对退还部分税款的，重新核定应纳税款并开具完税证后，经办人再开具退税凭证，办理退税手续。
税务部门在接到购房契税退税申请后，会对申请材料进行审核，审核通过后办理退税手续，将购房契税退还给申请人。
归档
经办人每半年将相关资料交档案管理人员归档。
建议
确保资料齐全：在申请退税前，请确保所有必要的资料都已准备齐全，包括购房合同、购房契税缴纳凭证、身份证明等。
及时申请：注意退税的申请时间，及时提交申请以确保能够顺利获得退税。
保持沟通：在申请过程中，保持与征收机关的沟通，以便及时了解申请进度和反馈信息。
通过以上步骤，您可以顺利完成电商购房的退税申请。