电商纳税成本的计算涉及多个税种和费用，具体如下：
增值税
小规模纳税人：按照商品销售收入（不含税）乘以3%的比率计算，每月进行申报。
一般纳税人：按照商品销售收入（不含税）乘以17%的比率计算，每月进行申报，并可抵扣进项税。
营业税
按照咨询、服务、广告收入乘以5%的比率计算，每月进行申报。
城市建设维护税
按照应纳增值税和营业税之和乘以7%的比率计算，每月进行申报。
教育费附加
按照应纳增值税和营业税之和乘以3%的比率计算，每月进行申报。
堤围防护费
按照营业收入乘以0.02%的比率计算，某些地区可能豁免收取。
个人所得税
个体户需按照经营所得的5%至35%的税率申报并缴纳个人所得税，实行代扣代缴。
企业所得税
按照利润总额乘以25%的税率计算，每季度进行申报。
建议
选择合适的纳税人身份：根据企业规模选择成为一般纳税人或小规模纳税人，以合理利用税率和抵扣政策。
定期申报和记录：确保每月按时申报和缴纳各项税费，并妥善保存相关财务记录，以备税务审计。
使用税费计算器：利用税费计算器工具，输入商品信息和税率，自动计算各项税费，提高计算准确性和效率。
咨询专业税务顾问：定期咨询专业税务顾问，了解最新税收政策变化，确保企业合规经营并优化税务成本。