对于电商企业在没有发票的情况下如何做账，以下是一些基本的处理方法和步骤：
确认收入
即使没有发票，电商企业也应当按照实际收到的服务金额确认主营业务收入。对于个人消费者，通常不需要发票，企业仍需按正常业务确认收入。
记录成本
提供电子商务服务所发生的可量化支出应作为主营业务成本进行核算。对于无法量化的支出，可以作为费用进行核算。
无票收入账务处理
未开票收入应按开票方式入账，例如通过银行存款等。对于无票收入，电商企业可以在税控系统中专门录入窗口进行记录。若客户日后需要发票，企业应留到开票后再做收入，避免不必要的调整。
纳税调整
对于无法取得发票的支出，若没有合法依据，不得税前扣除。在年末所得税汇算清缴时，应进行相应的纳税调整。
发票管理
建议电商企业保存所有相关的交易记录，如电子小票、银行转账记录、现金冲正记录等，以备日后查询和可能的税务审查。
其他注意事项
对于刷单等虚假收入，应当调增缴税。对于单位内职工的佣金，可以计入工资，通过工资发放；如果不是单位员工的佣金，可以要求对方提供佣金发票，才支付佣金，或者代对方到税务机关代开佣金发票，不过要扣税款。
结合以上信息，电商企业在没有发票的情况下，应当严格按照实际业务发生额确认收入和成本，对于无法取得发票的支出进行纳税调整，并在税控系统中做好相应的记录。同时，企业应妥善保存相关交易记录，以备税务审查。