自营电商的纳税方式主要涉及增值税、城市维护建设税、教育费附加、个人所得税和企业所得税等。以下是具体的纳税步骤和计算方法：
增值税
计算方法：增值税是基于商品销售收入（不含税）乘以3%的税率计算。对于小规模纳税人，通常以月度为周期进行申报。
注意事项：如果电商企业是一般纳税人，还可以抵扣进项税。
城市维护建设税
计算方法：应缴纳的城市建设维护税等于应纳增值税和营业税之和，再乘以7%（按月度申报）。
教育费附加
计算方法：教育费附加是根据应纳增值税和营业税之和，乘以3%（按月度申报）。
个人所得税
计算方法：个人所得税实行全员全额代扣代缴，无论工资薪金是否超过2000元，都需要申报。
税率：个人卖家的税率是3%-45%，个体户的税率是5%-35%，企业卖家的税率则为25%。
企业所得税
计算方法：企业所得税是基于利润总额乘以适用税率（一般为25%）计算。
优惠政策：对于小微企业，如果年底利润在100万元以内，按2.5%征收企业所得税；如果利润在100-300万元之间，超出部分按10%征收；如果利润超过300万元，则统一按25%征收。
其他费用
堤围防护费：在某些地区，可能会收取营业收入乘以0.02%的堤围防护费，但有些地方可能豁免收取。
在线办理
电子税务局：电商企业可以通过电子税务局进行税务的在线办理，包括申报和缴纳税款。
建议：
了解税收政策：自营电商企业应详细了解国家和地方的税收政策，确保合规纳税。
选择合适的纳税人身份：根据企业规模和业务情况，选择一般纳税人或小规模纳税人身份，以享受相应的税收优惠。
定期申报和缴税：按时进行税务申报和缴税，避免因逾期而产生罚款和滞纳金。
咨询专业税务人员：如有复杂税务问题，建议咨询专业税务人员或会计师，以确保准确无误地完成税务申报和缴纳。