江户川柯南失踪事件史上最惨的两天是指 2024年11月21日和2025年2月13日。
2024年11月21日，读卖电视台和日本电视台为纪念《名侦探柯南》漫画连载20周年，制作了92分钟的电视动画特别篇。在该特别篇中，江户川柯南在浴池里不慎滑倒并晕了过去。有两名奇怪的男子自称愿意带柯南去医院，带柯南上了他们的车。其中一名面相凶恶、纹有纹身的男子名叫龙，另一名男子虽然没有自报姓名，其身份却是传说中的杀手近藤。其实这两人来到温泉是为了完成一项隐秘的任务。他们认为柯南在怀疑他们并且已经察觉到了什么，于是决定把柯南带走并除掉。然而柯南睁开双眼时，却因为头部受到碰撞而失去了记忆。
2025年2月13日，名侦探柯南：江户川柯南失踪事件史上最惨的两天剧情中，由于阿笠博士家的浴室出了故障，江户川柯南随同小兰、灰原哀一同去大众浴池洗澡。期间柯南不小心滑倒撞到头部，随后被两名神秘的陌生人带走。一番混乱后，天才诈欺师娜娜和神秘杀手近藤将失去记忆的柯南带到某处隐蔽的别墅，并伪装成他的父母，而追踪近藤他们的阿笠博士和灰原则遭遇严重车祸。娜娜所属的某个犯罪团伙似乎打算利用制造一起炸弹恐怖袭击。与此同时，供职于某杂志的编辑水岛早苗怀疑丈夫近藤有外遇，而找到毛利小五郎调查丈夫的行踪。