电商公司计算费用的方式主要有以下几种：
纯服务费收费模式
按照合作时间收取固定金额的店铺运营服务费，无论销售额如何，费用都保持不变。这种模式的服务费实际上是给代运营公司的人工费用。
纯佣金模式
按照销售额的一定比例收取佣金，例如3%或5%等。这种模式不需要额外的服务费，但可能存在较多不确定因素，需要仔细甄别。
混合收费模式
既收取固定服务费用，用来支付代运营公司工作人员基础薪资；又按照销售额的一定比例收取佣金，以此激励相关工作人员去冲数据，提升店铺成交额。这种模式结合了服务费和佣金提点，适用于不同时间段的运营需求。
平台交易佣金
平台从卖家交易中抽取的一部分费用，通常是交易金额的一定比例。这种方式可以保证平台的利益，同时也可以减轻卖家的负担。
服务费
适用于需要平台提供额外服务的卖家，例如拓展市场、广告投放等。费用通常根据服务的种类和效果而定。
广告费
平台提供广告位，卖家通过竞价获得这些广告位来推广产品。平台会从卖家的广告费中抽取一定比例的费用。
会员费
部分平台提供会员服务，会员可以享受更多的优惠和服务。
按服务人数收费
根据服务人数和时间来计算费用，适用于小型电商企业或初创企业，能够根据企业的实际需求灵活调整服务人数和时间。
按项目收费
根据具体项目的需求和难度来定价，适用于有特定需求的大型电商企业或品牌。
按日咨询量收费
次月初结算上月的平均日咨询量，价格范围大概是每月800元到几千元不等，具体费用与咨询量、类目、产品种类等有关。
临时客服收费
按天收费，主要针对大促活动、节假日等突发状况需大量客服的情况，价格一般为200元/人/天。
拼席客服托管模式
每月费用在几百到几千元不等，价格除了跟咨询量有关，还跟类目、产品种类有关，适用于需要根据实际咨询量来调整费用的场景。
按月收费
根据店铺的规模和需求，按月支付一定的托管费用，适合长期合作。
按季度收费
与按月收费类似，但按季度支付托管费用，适合短期合作或项目制合作。
按销售额提成
根据销售额的一定比例提成，适用于代运营公司或外包客服服务。
在选择电商公司的收费模式时，商家应根据自身的业务需求、预算和长期规划进行综合考虑，以确保选择到最适合自己的收费方式。同时，为了避免不必要的损失，商家在签订合同前应仔细审查合同条款，确保费用与服务内容相匹配。