电商多个店铺的税务处理方式主要取决于店铺的注册类型、经营规模以及所在国家的税务法规。以下是一些基本的税务处理步骤和注意事项：
确定店铺类型
个人店铺：通常需要缴纳个人所得税，税率根据所得额的不同而变化，一般在3%-45%之间。
个体户店铺：需要缴纳个体经营所得，税率通常在5%-35%之间。
公司店铺：需要缴纳增值税和企业所得税。增值税率根据店铺的纳税人身份（小规模纳税人或一般纳税人）而定，通常为3%或13%。企业所得税率则根据企业利润的不同，在5%-25%之间。
合并收入
如果多个店铺都是以同一主体（如同一身份证或同一公司）运营，那么这些店铺的收入应当合并计算，并按照相应的税率缴纳个人所得税或企业所得税。
如果每个店铺是以不同主体运营，那么每个店铺的收入应当分别计算，并分别按照相应的税率缴纳税款。
增值税
无论店铺类型如何，都需要缴纳增值税。对于小规模纳税人，季度销售额30万元以下免税，超过部分按1%征收。
对于一般纳税人，所有货物的税率为13%。
企业所得税
企业需要计算经营收入减去所有支出后的利润，并根据利润征收企业所得税。小微企业享受一定的税率优惠，100万元以内利润按2.5%征收，100-300万元利润按10%征收，300万元以上统一按25%征收。
申报与缴纳
电商店铺需要定期申报税款，通常不同国家的申报周期不同，有些国家要求每月申报，有些则是每季度申报。
缴纳税务时，需要精确计算销售收入和对应的税款，并保留好相关凭证。
其他注意事项
如果店铺有分红，股东需要按照20%的税率缴纳个人所得税。
在申报税务时，需要注意销售收入应按不同国家分别计算，并根据当地的税率进行缴纳。
建议在处理多个店铺的税务时，咨询专业的税务顾问或会计师，以确保合规并优化税务负担。同时，定期更新和了解最新的税法规定，以便及时调整税务策略。