自营电商退税的计算方法主要基于增值税和消费税的退还原则，具体计算步骤如下：
计算当期应纳税额
当期应纳税额 = 当期内销货物的销项税额 + （当期出口货物离岸价 × 外汇人民币牌价 × 征税率） - 当期全部进项税额
其中，当期全部进项税额包括国内购料、水电费用、允许抵扣的运输费、以及海关代征增值税等法规允许抵扣的进项税额。
计算当期应退税额
当期应退税额 = 出口货物离岸价格 × 外汇人民币牌价 × 退税税率
退税税率根据国家规定的不同产品退税率而定，不同货物的退税率可能有所不同，如17%、14%、13%、11%、9%、5%等。
免抵退税的计算
免抵退税额 = 出口货物离岸价 × 外汇人民币牌价 × 出口货物退税率 - 免抵退税额抵减额
免抵退税额抵减额 = 免税购进原材料价格 × 出口货物退税率
免税购进原材料包括国内购进免税原材料和进料加工免税进口料件，其中进料加工免税进口料件的价格为组成计税价格。
会计分录
根据“当期免抵退税不得免征和抵扣的税额”，借：主营业务成本，贷：应交税费——应交增值税（进项税额转出）
根据“当期免抵税额”，借：应交税费——应交增值税（出口抵减内销产品应纳税额），贷：应交税费——应交增值税（出口退税）
根据“当期应退税额”，在实际收到退税款时，借：银行存款，贷：应交税费——应交增值税（出口退税）。
综上所述，自营电商退税的计算方法涉及多个因素，包括货物的离岸价格、外汇人民币牌价、征税率和退税税率等。具体的计算步骤和会计分录也需要根据相关法规和政策进行操作。