要查询电商收入，电商企业可以通过以下几种方法进行：
核对银行账户的资金流动
税务机关通常会审查电商企业的银行账户，核实资金流动情况，以确认收入的真实性。
核对第三方支付平台的交易记录
电商企业可以与第三方支付平台（如支付宝、微信支付）进行数据共享，获取商户的交易明细，包括交易时间、金额、交易双方信息等，从而核实企业的真实收入情况。
检查与物流公司的发货记录对账
通过与物流公司的发货记录进行对账，电商企业可以确认订单的实际销售情况，进而确认收入。
对比企业申报的销售额和网络平台的销售数据
税务机关可以与网络平台合作，获取商家的销售数据，包括销售额、交易数量、退货情况等信息，以协助税务机关进行税收管理和查验。
买家确认收货时确认收入
电商企业可以在买家确认收货时确认收入，具体操作包括在系统上建立一个虚拟客户，每月汇总所有发货的订单，按品项进行分类，月底时制作发货单来确认收入。
查看财务账户
电商企业可以查看财务账户，如果客户是网上付款，客户的付款就会出现在企业的财务账户中，从而确认收入。
查看业务记录
电商企业可以从业务记录中查看客户的付款及服务结果，以便确认收入。
核对客户收货信息
对于实物商品的订购者，电商企业可以根据客户收货信息来检查订单，从而确认收入。
使用电商平台的数据统计功能
电商企业可以通过登录电商平台后台的数据统计功能，查看店铺的销售数据报告，包括订单数量、销售额、客单价等关键指标。
查看支付宝账单详单
电商企业可以进入支付宝后台，查询淘宝店铺宝贝销售收入，通过标签进行交易记录筛选，查看收支明细。
使用生意参谋
电商企业可以通过生意参谋查询店铺的收入情况，包括支付金额、交易构成等数据。
查看抖音小店后台
对于抖音小店，电商企业可以登录抖音小店后台，进入“收益”页面，查看收益总额和收益明细。
通过以上方法，电商企业可以全面了解自己的收入情况，确保税收的准确性和合规性。建议电商企业定期对数据进行核对和清理，确保数据的准确性和完整性，并根据需要对数据进行筛选和分类，以便更深入地了解收入结构和变化趋势。