跨境电商申请退税退款的流程如下：
出口退（免）税备案
企业首先需要在首次申报出口退（免）税时，向主管税务机关办理出口退（免）税备案手续。具体操作是登录电子税务局，选择相关功能菜单进行备案。
准备申请材料
企业需要准备一系列相关的材料，包括出口货物报关单、出口销售发票、进货发票、收付款单、出口货物运单和出口保险单等。此外，还需要提供其他相关资料，如海外仓证明、跨境电商平台店铺资质页面截图、店铺成交记录截图等。
填写申请表格
在申请退税前，企业需要填写退税申请表格，详细填写退税的相关信息，如退税原因、退税金额等。
提交申请材料
将填好的申请表格和相关证件和文件提交到当地相关部门，如海关、税务局等。
审核申请材料
相关部门会对申请材料进行审核，核对个人或企业信息和所提供的证件和文件是否一致。
批准退税申请
审核通过后，相关部门会批准退税申请，并将退税金额转入个人或企业账户中。
办理出口退（免）税申报
企业在货物报关出口之日次月增值税纳税申报期内，通过电子税务局或到办税大厅现场或通过国际贸易“单一窗口”办理出口退（免）税申报。
海外仓备案
跨境电商企业除应具备跨境电商备案以及税务局企业备案外，还需在海关监管处完成海外仓备案。
建立订仓单信息
向跨境电商公服平台上传报关要件信息，生成定仓单号。
通关申报
企业通过国际贸易单一窗口申报9810报关单，海关总署进行查验和放行。
组织物流
选择符合企业需求的物流将货物发往海外仓。
海外销售
货物在跨境电商平台进行销售。
提交退税申请
企业提供报关单及平台结算单等资料供银行查验，使用外币和离岸人民币转账。然后，准备出口退税出口明细申请表、出口退税进货明细申报表、出口货物收汇申报表和对应佐证材料申请退税。
建议企业在申请退税退款前，仔细了解相关政策和规定，确保所有材料和文件的准确性和完整性，以提高退税申请的通过率。同时，考虑到退税流程可能涉及多个部门和环节，企业应提前做好准备，合理安排时间，以确保退税过程顺利进行。